मीडिया रिपोर्ट्स में फैजल ने आमिर खान पर सम्पत्ति हड़पने का आरोप लगाया था। इसके बाद आमिर और उनके पिता ताहिर हुसैन की कस्टडी को लेकर भी विवाद की खबरें आई थी। साल 2007 में फैजल की मां और बहन ने उनके लापता होने की शिकायत दर्ज करवाई थी, इसके बाद पुलिस को वह लोनावला में मिले थे। फैजल को साल 2007, अक्टूबर में जेजे हॉस्पिटल में भर्ती भी किया गया था, जहां वह 5 सीनियर साइकायट्रिस्ट और साइकॉलजिस्ट की देखरेख में थे। इसके बाद कोर्ट ने फैजल की कस्टडी उनके पिता को देते हुए कहा था कि उन्हें हॉस्पिटल में भर्ती करने की जरूरत नहीं, वह महीने में दो बार हॉस्पिटल विजिट कर लें।