अटल सुरंग में यात्रियों के लिए सुविधाओं के साथ साथ इसका सामरिक महत्व भी है। खासकर चीन के साथ वास्तविक नियंत्रण रेखा (LaC) पर तैनात भारतीय सैनिकों के लिए यह लाइफलाइन का काम करेगी। इसकी मदद से हथियार और अन्य साम्रगी को आसानी से हर मौसम में बॉर्डर पर पहुंचाया जा सकेगा। इस टनल से हर मौसम में लद्दाख भारत से जुड़ा रहेगा। ऐसे में युद्ध या संकट के समय सीमा पर इस रास्ते से आसानी से हथियार पहुंचाए जा सकेंगे।