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वाजपेयी सरकार ने भारत की आर्थिक तरक्की तेज की थी। उन्होंने कारोबार आसान करने के लिए कई सुधार किए। इसके साथ ही नीजिकरण को बढ़ावा दिया।
वाजपेयी के नेतृत्व में इन्फ्रास्ट्रक्चर का तेजी से विकास हुआ। प्रधानमंत्री ग्रामीण सड़क योजना और राष्ट्रीय राजमार्ग विकास परियोजना जैसी सड़क कनेक्टिविटी की कई योजनाएं चलाई गईं।
वाजपेयी सरकार ने सर्व शिक्षा अभियान चलाया। संविधान के 86वें संशोधन द्वारा 6 से 14 वर्ष की आयु के बच्चों के लिए मुफ्त और अनिवार्य शिक्षा को मौलिक अधिकार बनाया गया।
1999 में वाजपेयी सरकार नई दूरसंचार नीति लाई। इससे नागरिकों के लिए किफायती दूरसंचार उपलब्ध कराना संभव हुआ। सुदूर, पहाड़ी और आदिवासी क्षेत्रों में मोबाइल नेटवर्क का विस्तार हुआ।
वाजपेयी की सरकार में भारत ने पोखरण में दूसरा परमाणु परीक्षण किया। भारत को परमाणु बम की क्षमता वाला देश होने का दर्जा मिला।
15 अगस्त 2003 को अटल बिहारी वाजपेयी ने लाल किला से मिशन 'चंद्रयान-I' की घोषणा की। इसके बाद इसरो ने राष्ट्रीय चंद्र मिशन टास्क फोर्स की स्थापना की।
1998 में भारत और पाकिस्तान ने परमाणु परीक्षण किए। इससे माहौल नाजुक हो गया था। दोनों देशों ने 1999 में लाहौर घोषणा पर साइन किए।
पाकिस्तानी सैनिकों ने घुसपैठ कर कारगिल की ऊंची चोटियों पर कब्जा कर लिया था। वाजपेयी ने मजबूती से काम किया और जंग शुरू की। भारतीय सैनिकों ने पाकिस्तानियों को खदेड़ा।